Може и с seed да стане. Ще потърся още варианти докато още на съм почнал да изграждам структурата (все още разучавам laravel 5 ) .
Ако не намеря нещо подходящо ще го направя по единственият начин за който се сещам, а именно ще напиша един прост .sql файл
с новата структурата на схемата с Dumping data спрямо новата схема, доста дървен метод с опасност да се счупят доста неща, дано открия някое по елегантно решение.